转录组数据分析与科研项目设计
转录组的一般研究方法
转录组-01.导论
转录组-02.从转录组中获取mRNA的表达量
转录组-03.从转录组中获取mRNA的位置和结构
转录组-04.从转录组测序数据中获取DNA水平的差异
转录组-05.从转录组中研究非编码RNA的功能
转录组的未来发展方向
01.转录组的多组学研究——转录组 基因组
02.转录组的多组学研究——转录组 表观组
03.转录组的多组学研究——转录组 翻译组
04.转录组的多组学研究——转录组 蛋白组
非编码转录组的科研项目设计
01.非编码RNA常见的生物学功能
02.非编码RNA的功能验证思路
03.非编码RNA分析数据库及工具推荐
编码转录组的数据分析
01.测序数据过滤和质控
02.有参转录组序列比对
03.基因表达定量
04.差异表达分析
05.差异基因功能富集分析
非编码转录组的数据分析
01.lnRNA-序列比对与转录本拼接
02.非编码转录本去冗余-cuffcompare
03.lnRNA的鉴定-CPC2
04.lnRNA与mRNA的共表达分析
05.lnRNA与miRNA互作分析
06.转录组结果可视化-IGV的使用
转录组案例解析
01.拟南芥空间单细胞转录组案例
02.丹参酮转录组研究案例
03.PALM-seq探索新冠患者血浆游离RNA的分子特征