福利！这个知识库在线就能看，继续免费！
时间：2020-01-13 09:44:09 来源：华大科技BGITech 浏览数：8445
以下文章来源于华大科技BGITech ，作者归佳栋
华大科技BGITech：深圳华大基因科技服务有限公司（简称华大科技）——华大基因（BGI）旗下子公司——肩负集成智慧、催化科技的使命，专注于服务生命科学研究者和搭建全产业链服务网络，致力于成为全球生命科学研究机构的首选合作伙伴。
外显子的数据不会看怎么办？
miRNA的靶基因怎么预测？
MeV怎么画热图？
GSEA软件怎么用？
数据上传NCBI报错怎么办？
单细胞测序有没有最新的文献解读？
测序建库的method怎么写？
……
以上是合作伙伴在向技术支持寻求帮助时，经常会提到的问题。
华大科技去年9月推出的在线知识库，涵盖了高通量测序的各种知识和教程，并在不断更新中。自上线以来，知识库获得了合作伙伴的广泛好评。
根据日常的技术回复统计，近期我们对知识库内容进行集中升级，知识体量进一步上升，随时在线查看，继续免费！！！
先给大家看看更新总览：
√ 结果解读视频
新增ATAC-seq、微生物和质谱类产品，更新WGS & WES
√ 产品帮助文档FAQ
扩容，并新增：微生物和质谱类产品帮助文档
√ 测序基础概念
√ 数据实用技巧
新增：KOBAS、DAVID、MapMan、AgriGO、Metascape软件使用，利用FZ上传SRA数据等等，新增培训课程视频（课程涵盖Dr.Tom、Excel、GSEA和Cytoscape），新增小RNA靶基因工具教程
√ 文章套路解读（扩容）
√ 提取建库的实验SOP和方法描述（新增）
让我们具体一一介绍：
01、结果解读视频
此次升级，知识库新增了ATAC-seq产品解读视频，更新了WGS和WES的解读视频。ATAC是一个较新的技术，拿到数据结果后，很多合作伙伴往往不知道该如何利用和解读。WGS和WES方面，则新添了实际案例以帮助挖掘数据。
整体来说，这部分内容涵盖mRNA、非编码RNA、DNA、表观和动植物重测序等产品的报告（report）和数据文件（data）解读，针对每一个条目、每一个文件及概念都有详细的解读视频。
图1 WES & WGS视频解读截图
02、产品帮助文档FAQ
蛋白和代谢类的产品FAQ此前没有收录进来，本次更新成功收录。另外，知识库新增了各个方向的高频提问，方便大家搜索。
总的来说，此部分收录了各类FAQ问题，涵盖所有科服核心产品，从取样建库、基础分析到高级分析等每个步骤均有涉及，全面解答大家的疑惑；同时，我们定期更新收集到的问题，使数据库保持在最全最新的状态。
图2 帮助文档FAQ内容截图
03、相关测序概念
此部分囊括了常见概念、基因组变异相关概念、组学概念、数据文件格式的介绍、中心法则相关概念和常见数据库的介绍。
图3 NGS相关概念目录
04、数据实用技巧
这部分的更新内容非常多，涉及了各种第三方软件的使用、NCBI数据的上传、定量PCR实验的引物设计等，尤其是针对Excel、GSEA和Cytoscape三个工具录制了强大的培训视频，从原理、操作等方面带领大家掌握和使用。具体更新内容如下：
1）新增KOBAS、DAVID、MapMan、AgriGO等富集工具使用教程，Metascape注释软件使用教程；
2）新增上传16S数据以及利用FileZilla上传SRA数据的教程；
3）新增引物设计方法，协助合作伙伴开展qPCR验证实验；
4）新增各大数据库参考序列查找方法，涵盖主流数据库的不同物种；
5）新增在线培训视频录播，内容涵盖Dr.Tom、Excel、GSEA和Cytoscape；
6）新增小RNA专题，主要涉及靶基因工具的简单教程；
7）充实Excel作图系列教程到应用九，涵盖各类热图绘制。
图4 Excel技巧目录
05、文章套路解读
分析整理已发表文章的思路，可以帮助我们设计课题实验和样本分组。因此，我们收集了不同产品方向的2018-2019年最新论文，搭配解读PPT直观展示，通过文章思路分析和结果解读，拆解最新最全的文章套路，协助大家设计实验方案和分析思路。本次扩容，重点新增10X单细胞转录组、表观、免疫组库、微生物等产品的文章解读。
图5 文章解读部分截图
06、提取建库的实验流程和方法描述
这是知识库的全新模块！很多小伙伴在撰写文章Method时，苦于不清楚具体的建库测序步骤，更无法使用英语来描述，因此，此部分展示了常规DNA、RNA测序产品的提取和建库方法，并改编为方法method英文段落，协助合作伙伴撰写英文文章！
图6 实验流程文件夹部分截图
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